Tout commence au Pérou, où beaucoup ont voulu voir le berceau de l'Atlantide...

Margaux et son père, un archéologue sous-marin, plongent dans un lac andin pour chercher des indices de la présence de l'Atlantide. Mais des Indiens les surprennent et les menacent de mort, les prenant pour des chasseurs de trésors.
La jeune fille leur raconte alors la légende de l'Atlantide, la civilisation engloutie. Séduit par l'histoire, le chef leur propose de les conduire là où ils trouveront peut-être des vestiges de ce qu'ils cherchent.
Ils traversent la jungle et parviennent dans une grotte, où les anciens Incas gardaient leurs morts. Ils croient être tombés sur des zombies, mais ce sont en fait des momies. En inspectant, la grotte, l'archéologue et sa fille tombent sur des Nazis, venus eux aussi chercher des traces de l'Atlantide en Amérique du Sud. Le père et la fille s'enfuient...
Du Pérou à la Crète, en passant par New York, ils vont vivre une aventure riche en découvertes mais aussi pleine de dangers...